比萨大学由教皇克莱门特六世在1343年9月3日创建，其历史可上溯到11世纪，是欧洲最古老而优越的大学之一。比萨大学首先教授的科目是神学、民法、教会法和医学。 1355年，但丁《神曲》的著名评论家弗朗切斯科·达·布蒂（Francesco da Buti）开始在比萨大学任教。比萨及比萨大学在15世纪之交经历了一段危机时期，佛罗伦萨对城镇的征服导致该大学于1403年关闭。1473年，由于洛伦佐·德·美第奇（Lorenzo de Medici），比萨大学恢复了系统发展。
1486年，学校修建了一座用于上课的建筑物。该建筑物后来称为Palazzo della Sapienza，意即“知识大厦”，位于14世纪的格兰诺广场（Piazza del Grano）。小天使的形象被放置在“富裕之门”（“Dell'Abbondanza”）上方，通往广场，今天仍然是大学的象征。
1494年叛乱和与佛罗伦萨的战争之后，比萨大学经历了一段衰落，并被转移到皮斯托亚（Pistoia）、普拉托（Prato）和佛罗伦萨。 1543年11月1日，在科西莫一世·德·美第奇公爵的统治下，大学的重新开业典礼被视为第二次就职典礼。1545年的法规进一步提高了大学的质量，Pisan雅典娜神庙成为欧洲最重要的教学和研究之一。
在美第奇大公国时期，大学作为国家机构的作用更加突出。贸易保护主义政策确保了学者和教师的核心力量。科西莫一世、费迪南多一世和费迪南多二世颁布的法律规定，那些打算获得学位的人必须参加比萨学院。许多著名人物在比萨演讲，尤其是在法律和医学领域。在洛雷纳斯大学的领导下，大学的发展得以继续。他们完成了天文台的建设（由Medicis发起的一个项目），并通过重要出版物丰富了大学图书馆。帮助开发了植物园和自然科学博物馆，并建立了包括实验物理和化学在内的新教席。
1839年至1840年间，教育总监乔吉尼（Gaetano Giorgini）将比萨大学的院系数量增加到六个，即神学、法律、文学、医学、数学和自然科学，从而对比萨大学进行了最重要的改革。乔吉尼还创造了世界上第一个农业和绵羊养殖教席。
随着意大利王国的诞生，比萨大学成为统一的意大利最负盛名的文化机构之一。第一家欧洲历史语言学研究所于1890年在比萨成立。在墨索里尼法西斯主义时代，比萨神庙是政治辩论和反法西斯组织的活跃中心。第二次世界大战后，比萨大学恢复了许多知识领域的前卫学习风格。二战前建立了工程系和药学系，二战后又增加了经济学、外语文学和政治学系。
如今，比萨大学拥有20个系，在农业、天体物理学、计算机科学、工程、数学、医学和兽医学等领域设有高级研究中心。该大学与国家研究委员会的皮桑研究所，许多具有国家和国际重要意义的文化机构以及工业，尤其是信息技术有着密切的联系，后者在1960年代和1970年代在比萨经历了快速扩张。
比萨大学位于意大利中部城市比萨，大学就在市中心，骑自行车行走很方便。比萨以斜塔著称，在罗马时代做为著名的海港曾繁盛一时。进入中世纪之后追随北方威尼斯、热那亚的脚步，将势力范围扩大至地中海。比萨伽利略机场是意大利的主要国际机场之一，许多欧洲航班和国内航班都在此进出。
比萨是一座学园都市，学生占总人口的百分之五十左右，学习氛围很浓，大家自由支配空余时间，可以去图书馆大学各院系自习室自习。比萨城内有很多的大学院系以及院系下属图书馆，上课时教授讲课思路明确，下课时会为所有学生开放接待时间。有不懂得问题大家可以在接待时间内自由咨询教授，并且能在比萨大学授课的教授都是意大利甚至欧洲著名的一些研究机构的泰斗。
比萨大学下设的20个学院中包括农学院，经济学院，药学院，法学院，文学和哲学院，外国语和外国文学院，医学院，兽医学院，工程学院，数学，物理，自然科学学院和政治科学院等。这些学院星罗棋布地坐落在比萨城内，但各学院的学生秘书处集中在一处，位於城东的比萨大学办事大厅内。
比萨大学特别开设了接待服务。根据与有关公寓、招待所签署的协议，比萨大学可以合理价格提供符合现行法规标准的一定数量的居住床位。
学校有16个图书馆，拥有上百万册图书、7500余册当今发行的杂志、大约3000个阅读座位和115台电脑供读者使用。图书目录可以在线查阅，并与比萨市的其他图书馆链接。很多图书馆都一直开放到 23点，以便保证最大限度的发挥其功能。
比萨大学系与系之间或单独的研究中心有25个；博物馆和收藏中心有13个；大小图书馆有16个，图书馆藏书40万册，期刊840种。
1、比萨大学是大学研究协会(URA)唯一意大利成员；
2、比萨大学是精英化教育体制，拥有比萨高等师范学院及比萨圣安娜高等学校，三校师资共享，教学质量有很高保障；
3、欧洲唯一一所进入“大学研究学会”的科研型大学。
比萨大学是一所拥有古老传统的、与时俱进的大学，是伽利略学医所在地，世界公认的理工名校。在上海交大2005年全球大学排名榜上，比萨大学是意大利三所进入前150强的大学之一。比萨大学包括了高等师范学院和圣安娜学院这两所意大利名校。学校积极参与马可波罗计划，并向中国学生提供大量名额。
1、物理
2、计算机科学
3、管理
4、战略
5、数学
比萨大学非常重视教育教学，学校的教学质量和口碑都非常不错，无论是上课还是考试都比较严格，而且有些教授对学生的出勤率也非常看重。
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